Problemet med udryddelse af nogle dyr er ikke det sidste sted i evolutionsteorien og er af største vigtighed i Darwinsk undervisning. Antallet af arter, der lever på nuværende tidspunkt, optager kun en ubetydelig del af det samlede antal dyr, der nogensinde er dukket op på planeten (mindre end 1%). 99% af kategorierne er endelig uddød, og der er mange grunde til dette.
De mest modtagelige for udryddelse er dyr, der findes et eller flere steder i geografisk begrænsede områder. Hvis hele området har gennemgået menneskelig aktivitet, kan arten, der lever i det, forsvinde. Den direkte årsag til udryddelsen af visse dyretyper under naturlige forhold er et fald i antallet af dem under det kritiske niveau, bestemt af lovene i populationsgenetik. Kritisk er niveauet for overflod, under hvilken muligheden for tæt beslægtet krydsning bliver stor, hvilket fører til et fald i arternes genetiske mangfoldighed. Som et resultat er der en andel afkom med medfødte lidelser, der øger dødeligheden i nye generationer. Arter, der er dannet som et resultat af en eller flere populationer, er også udsat for hurtig udryddelse. Enhver kategori kan forsvinde som følge af brande, jordskælv, sygdomme og menneskelig aktivitet. Kategorier med forskellige populationer er mindre tilbøjelige til at udryddes. Sammenlignet med små har store dyr enorme individuelle territorier. De har brug for en masse mad, og de bliver ofte bytte for mennesker. Store dyr er mere modtagelige for udryddelse, ikke kun fordi de er bytte, men også fordi de konkurrerer med mennesker i jagten på vildt, undertiden angriber mennesker og husdyr. Der er populationer af dyr, der lever af store områder. De er også tilbøjelige til at udryddes, forudsat at en del af deres rækkevidde ødelægges. Med den naturlige udvikling af naturen tvinger miljømæssige ændringer nogle kategorier til at tilpasse sig nye forhold. Dyr, der ikke er i stand til at tilpasse sig, er tvunget til at migrere til egnede levesteder. Ellers er deres art truet af udryddelse. Det hurtige tempo i udviklingen af naturressourcer overgår tilpasningen og efterlader migration som den eneste mulighed. Kategorier af dyr, der ikke kan krydse marker, veje og andre forstyrrede levesteder, er dømt til udryddelse Utilitarisme har altid været en forudsætning for udryddelse af meget værdifulde dyrearter. Overudnyttelse kan drastisk reducere befolkningsstørrelser. Hvis jagt ikke er reguleret ved lov, kan visse typer dyr være på randen af udryddelse.
